三大基因組編輯工具在誘導多能干細胞中的應用情況如何??
ldy2311
2021-09-16 05:55
將患者成體細胞重編程為誘導多能干細胞的iPS技術,在構建疾病模型和新藥開發中有著很高的應用價值。然而由于遺傳變異等原因,iPS構建的疾病模型可能與患病細胞并不完全一樣。現在的潮流是,將基因編輯工具用到iPS中去,獲得同基因型的疾病模性。日前,Stem Cells and Development雜志上刊登的一篇綜述性文章全面探討了這個問題,我們可以在該雜志的網站上免費讀到這篇綜述。
西奈山伊坎醫學院的Ihor Lemischka、Huen Suk Kim、Jeffrey Bernitz和Dung-Fang Lee在這篇文章中,詳細介紹了iPSC構建疾病模型的新進展,分析了三種主要基因組編輯工具在這一領域中的應用前景(鋅指酶ZFN、TALEN和CRISPR)。
“iPSC在藥物篩選和疾病模型中越來越受到重視,而基因組編輯工具可以幫助我們進一步完善這一過程。Ihor Lemischka等人為我們展示了這些技術的優勢和短板,”雜志主編Graham C. Parker博士說。
人胚胎干細胞(hESC)是研究早期人類發育的理想工具,也是細胞替代治療的寶貴資源。然而免疫排斥和倫理學爭議阻礙了hESC的臨床使用。不過,山中伸彌及其同事開發的iPS技術繞過了這些障礙。在那之后,iPS技術又迎來了多次改進。現在人們已經利用這一技術在體外獲得了多種類型的細胞(神經元、心肌細胞、造血細胞等),并且在小鼠模型中對這些細胞進行了功能研究。
將來自患者的iPSC誘導成為受疾病影響的細胞類型,可以模擬人類疾病和進行藥物篩選。有時iPS建立的疾病模型與真實的疾病狀態并不完全一致。一般來說,對于有著明確致病突變和患病細胞的單基因疾病,iPS技術可以很好的再現其病理現象。但在其它情況下,iPSC并沒有那么成功,導致無法進行精確的分析。
為此,iPSC與對照之間的基因變異應該被去除,確保更精確的比較和分子分析,在模擬疾病時。越來越多的人開始關注基因組編輯工具,希望由此獲得與患病細胞基因型完全相同的疾病模型。ZFN和TALEN已經在這類研究中幫人們成功鑒定了一些疾病新機制。在這種情況下,理解基因組編輯工具的特點和局限性,對于建立更好的疾病模型非常關鍵。
目前,iPS構建疾病模型主要用到的基因組編輯工具是ZFN,也有少數研究使用了TALEN,但CRISPR在這方面的應用還未見報道。ZFN和TALEN的問題在于,它們都會引發脫靶效應,而且在靶標甲基化基因組位點時效率較低。CRISPR系統易于構建,對DNA甲基化不敏感,而且在人類細胞中的效率更高。不過CRISPR的脫靶效應也不容忽視。
此外,生成完美iPSC還有許多因素需要考慮,包括選擇標記、載體、培養條件、基因校正策略、脫靶效應和基因組的完整性。
將患者成體細胞重編程為誘導多能干細胞的iPS技術,在構建疾病模型和新藥開發中有著很高的應用價值。然而由于遺傳變異等原因,iPS構建的疾病模型可能與患病細胞并不完全一樣。現在的潮流是,將基因編輯工具用到iPS中去,獲得同基因型的疾病模性。日前,Stem Cells and Development雜志上刊登的一篇綜述性文章全面探討了這個問題,我們可以在該雜志的網站上免費讀到這篇綜述。
西奈山伊坎醫學院的Ihor Lemischka、Huen Suk Kim、Jeffrey Bernitz和Dung-Fang Lee在這篇文章中,詳細介紹了iPSC構建疾病模型的新進展,分析了三種主要基因組編輯工具在這一領域中的應用前景(鋅指酶ZFN、TALEN和CRISPR)。
“iPSC在藥物篩選和疾病模型中越來越受到重視,而基因組編輯工具可以幫助我們進一步完善這一過程。Ihor Lemischka等人為我們展示了這些技術的優勢和短板,”雜志主編Graham C. Parker博士說。
人胚胎干細胞(hESC)是研究早期人類發育的理想工具,也是細胞替代治療的寶貴資源。然而免疫排斥和倫理學爭議阻礙了hESC的臨床使用。不過,山中伸彌及其同事開發的iPS技術繞過了這些障礙。在那之后,iPS技術又迎來了多次改進。現在人們已經利用這一技術在體外獲得了多種類型的細胞(神經元、心肌細胞、造血細胞等),并且在小鼠模型中對這些細胞進行了功能研究。
將來自患者的iPSC誘導成為受疾病影響的細胞類型,可以模擬人類疾病和進行藥物篩選。有時iPS建立的疾病模型與真實的疾病狀態并不完全一致。一般來說,對于有著明確致病突變和患病細胞的單基因疾病,iPS技術可以很好的再現其病理現象。但在其它情況下,iPSC并沒有那么成功,導致無法進行精確的分析。
為此,iPSC與對照之間的基因變異應該被去除,確保更精確的比較和分子分析,在模擬疾病時。越來越多的人開始關注基因組編輯工具,希望由此獲得與患病細胞基因型完全相同的疾病模型。ZFN和TALEN已經在這類研究中幫人們成功鑒定了一些疾病新機制。在這種情況下,理解基因組編輯工具的特點和局限性,對于建立更好的疾病模型非常關鍵。
目前,iPS構建疾病模型主要用到的基因組編輯工具是ZFN,也有少數研究使用了TALEN,但CRISPR在這方面的應用還未見報道。ZFN和TALEN的問題在于,它們都會引發脫靶效應,而且在靶標甲基化基因組位點時效率較低。CRISPR系統易于構建,對DNA甲基化不敏感,而且在人類細胞中的效率更高。不過CRISPR的脫靶效應也不容忽視。
此外,生成完美iPSC還有許多因素需要考慮,包括選擇標記、載體、培養條件、基因校正策略、脫靶效應和基因組的完整性。
