人MHC捕獲測序有什么作用？？？
jonedream
2021-10-31 10:06
人MHC捕獲測序技術是華大科技與NimbleGen合作開發，針對人主要組織相容性復合體MHC相關變異進行檢測的技術平臺。通過特制探針對人MHC核心區3.37Mb及側翼區1.6Mb進行捕獲，富集后進行高通量測序，針對這一特定基因區域進行針對性研究。該方法極大地提高了基因組中MHC區域的研究效率，具有通量高、成本低、結果準確等優勢，可廣泛應用于自身免疫性疾病、癌癥、器官移植、群體進化、法醫鑒定等領域。
其優勢有：
1、數據利用度高：利用少量的數據即可高深度覆蓋人MHC相關區域，針對性強；
2、覆蓋度高：捕獲區域大，目標區域的覆蓋度≥97%；
3、可分型數目多：可以對MHC區域的26個基因進行分型；
4、分型準確率高：分型準確率達到95%以上。
研究內容：
一、標準信息分析
1、去除接頭污染和低質量數據；
2、使用比對軟件將clean reads比對到人基因組上，并統計產出數據；
3、SNP檢測，注釋和統計；
4、InDel檢測，注釋和統計；
5、26個基因的HLA分型；
二、 高級信息分析
1、SNP，InDel與疾病的關聯分析；
2、26個基因的HLA型別與疾病的關聯分析。
具體可參考：http://www.bgitechsolutions.cn ... -mhc/
左邊安寧 2021-10-31 10:20
由華大基因和羅氏NimbleGen共同開發，采用NimbleGen SeqCap EZ Choice Library定制型液相序列捕獲產品，專門針對人MHC核心區3.37Mb及側翼區1.6Mb進行捕獲，成功實現了對常規擴增方法難以實現的高重復區域的高覆蓋和有效富集。
這個新方案可以輕松捕獲和富集人MHC高重復性區域，克服傳統PCR和基因組富集方法的局限性，可用于疾病和藥物研究領域。
人MHC捕獲測序技術是華大科技與NimbleGen合作開發，針對人主要組織相容性復合體MHC相關變異進行檢測的技術平臺。通過特制探針對人MHC核心區3.37Mb及側翼區1.6Mb進行捕獲，富集后進行高通量測序，針對這一特定基因區域進行針對性研究。該方法極大地提高了基因組中MHC區域的研究效率，具有通量高、成本低、結果準確等優勢，可廣泛應用于自身免疫性疾病、癌癥、器官移植、群體進化、法醫鑒定等領域。
其優勢有：
1、數據利用度高：利用少量的數據即可高深度覆蓋人MHC相關區域，針對性強；
2、覆蓋度高：捕獲區域大，目標區域的覆蓋度≥97%；
3、可分型數目多：可以對MHC區域的26個基因進行分型；
4、分型準確率高：分型準確率達到95%以上。
研究內容：
一、標準信息分析
1、去除接頭污染和低質量數據；
2、使用比對軟件將clean reads比對到人基因組上，并統計產出數據；
3、SNP檢測，注釋和統計；
4、InDel檢測，注釋和統計；
5、26個基因的HLA分型；
二、 高級信息分析
1、SNP，InDel與疾病的關聯分析；
2、26個基因的HLA型別與疾病的關聯分析。
具體可參考：http://www.bgitechsolutions.cn ... -mhc/
左邊安寧 2021-10-31 10:20
由華大基因和羅氏NimbleGen共同開發，采用NimbleGen SeqCap EZ Choice Library定制型液相序列捕獲產品，專門針對人MHC核心區3.37Mb及側翼區1.6Mb進行捕獲，成功實現了對常規擴增方法難以實現的高重復區域的高覆蓋和有效富集。
這個新方案可以輕松捕獲和富集人MHC高重復性區域，克服傳統PCR和基因組富集方法的局限性，可用于疾病和藥物研究領域。
