無創產前診斷如何排除個體差異進行定量分析??
香港中文大學的盧煜明(Dennis Lo)教授發明的利用母親外周血進行無創產前診斷有一個關鍵問題:母親外周血血漿中胎兒DNA占很小的比例,一般來說,胎兒DNA僅占DNA總量的10%左右。但胎兒DNA和母親DNA的比值不是一個定值,而是一個范圍很廣的不定值(2%-35%),而產前診斷需要定量,從而檢測胎兒染色體條數是否正常。<愛尬聊_百科網>
美國無創產前診斷公司Sequnome,通過檢測母血中甲基化DNA和沒有甲基化DNA的比值,來精確分析外周血中胎兒和母親DNA含量比值的辦法,使得診斷更準確。
不知國內的幾大無創產前公司華大基因、貝瑞和康和安諾優達是如何解決這個問題的?有知情者能夠回答一下?
快樂人L 2021-10-12 01:37
算Z-score的時候是不是這個影響就被弱化了
來看八卦專用 2021-10-12 01:41
我覺得解決這個問題的方式無非兩種,
第一種設置技術重復,提高儀器檢測的準確度,精密度,儀器檢測準確度高了,檢出限更低了,診斷也就更準確了,對吧?
第二種設置生物學重復,通過多次不同時間的取樣分析,取平均值,在統計學原理下,自然就可以使定量更為可信。例如,我們做實驗,一般需要做重復,在一定置信區間內重復度越高,這個值也就越可信了。
但問題是,不管是技術重復或是生物學重復,都會加大成本,在現在看來,各種檢測手段、檢測儀器的技術重復置信度可能相差不大,所以我們檢測1次,或許既可達到要求。但對于生物學重復來說,往往數值波動性較大,因此,合適的生物學重復次數對于檢測的準確度至關重要,在目前來看,主要是通過加深測序深度,設置2個以上的重復,來實現排除個體差異進行定量分析。
各大公司應該也是使用此原理來進行測序、后期分析的
xiaolfoen 2021-10-12 01:58
具體方法是檢測母血中甲基化DNA和沒有甲基化DNA的比值。這是一個精確分析外周血中胎兒和母親DNA含量比值的辦法,使得診斷更準確。