不知DNA磷硫酰化修飾基因組分布圖<愛尬聊_尬聊百科>譜研究進展如何？

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jkloooop 2021-11-17 03:42

　近日，上海交通大學生命科學技術學院、微生物代謝國家重點實驗室在DNA磷硫酰化修飾方面取得突破，《Nature Communications》在線發表了由德林教授研究小組的最新進展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences》。
DNA磷硫酰化修飾廣泛存在于細菌中，與細菌的自我防衛機制緊密相關，然而其序列特異性及在細菌基因組中的分布情況尚無報道。本工作以大腸桿菌Escherichia coliB7A為研究對象，建立了單分子實時測序（single molecule real-time sequencing，SMRT）和碘切割依賴的深度測序（deep sequencing of iodine-induced cleavage at PT，ICDS)兩種新穎的技術，測定了基因組水平DNA磷硫酰化修飾位點，首次獲得了精確的細菌基因組磷硫酰化修飾位點分布圖譜。
文章鏈接：http://www.nature.com/ncomms/2 ... .html

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小小_994 2021-11-17 03:47

近日，從上海交通大學獲悉，該校微生物代謝國家重點實驗室由德林研究小組在DNA磷硫酰化修飾方面取得突破。相關成果在線發表于《自然—通訊》雜志。
DNA是生命的遺傳物質，由碳、氫、氧、氮、磷五種元素組成。中科院院士鄧子新領銜的團隊在前期工作中發現了DNA上存在一種全新的修飾——磷硫酰化修飾。這一現象被國際同行公認為“迄今為止在DNA骨架上發現的第一個天然修飾”，也是目前在DNA骨架上發現的第六種元素。
由德林團隊以大腸桿菌Escherichia coli B7A為研究對象，建立了單分子實時測序和碘切割依賴的深度測序等兩種前沿技術，測定了基因組水平DNA磷硫酰化修飾位點，首次獲得了精確的細菌基因組磷硫酰化修飾位點分布圖譜。
據了解，這兩種測序方法相互補充，測得修飾位點具有保守的GpsAAC/GpsTTC短序列特征。而大腸桿菌中同樣存在一個DNA磷硫酰化修飾—限制系統，并且其基因組中只有部分GAAC/GTTC位點被DNA磷硫酰化修飾酶識別修飾。該發現表明，DNA磷硫酰化修飾—限制系統不同于經典的甲基化修飾—限制系統，具有特殊的作用機制。

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